Los fundamentos de la geotecnia marina no son distintos a los de la geotécnica terrestre. La diferencia principal estriba en la necesidad de usar medios específicos adaptados al medio subacuático. Por ejemplo se pueden realizar campañas de reconocimiento geotécnico mediante extracción de testigos y muestras ó realización de sondeos, con la única diferencia que deben hacerse desde plataformas flotantes en caso de sondeos o utilizando maquinaria hidráulica sumergible en caso de extracción de testigos.
Ocurre lo mismo con las técnicas geofísicas submarinas. Estas se usan para caracterizar el sustrato del fondo marino por métodos cuantitativos físicos como la sísmica de reflexión y una serie de métodos basados en la medida de campos electromagnéticos o eléctricos como la tomografía eléctrica. Estos métodos son muy útiles para abordar campañas de gran extensión como las requeridas en proyectos de infraestructuras portuarias y emisarios submarinos.